• SRA Toolkit (NCBI)
• BWA-MEM
• STAR
• SAMTools
• HTSeq
• DeSeq
• FastQC i MultiQC

riskassessment.icradev.cat

• lcorominas ecam (IWA, GIZ)
• lcorominas, vacuña, jcomas ecoadvisor (ACA, Global Omnium)
• lcorominas, ogutierrez innowatt (ICRA)

mesocosmos mesocosmos.icradev.cat

• sistema FTP
  • comentar amb afreixa reunió 30ABR
  • fer funcionar correctament
• mesocosmos live
  • comentar amb afreixa reunió 30ABR
  • receptes automàtiques (lògica)
  • (futur) disseny interfície

• [2024-01-10] nros: Tractament estadístic dades multivariants (PCA + ANOVA). Aprofitar plataforma waterdom.
• [2024-02-19] apedregal: Ajuda análisis estadístic (data.csv i pdf explicació mail)
• [2024-03-07] lbosch: Plataforma dedicada per anàlisi automàtic de dades amb estructura "n+m" columnes on "n factors", "m response variables" (anova.icradev.cat)
• comentar plataforma anova amb vicenç per fer difusió/seminari a icra

• Canviar part interpolació
• Calcular llindras a 5% i 1% per tenir tres franjes (verd, groc, vermell)
• Fer diccionari de scores per data on cada data és una pca diferent
• [2024-04-29] josep graficarà amb R segons JSON enviat
• enviat

• Recollir ordinador Fontajau
• Tractament de dades 2023 any sencer (optimizació potències)
• rebre documents pdf xavier agustí (ajuntament girona)

• sim changed
• internet working in router
• static ip sim card
  • dynamic dns configuration
  • get public ip through NAT
  • contractar ip fixa (mriva contacta amb agència catalana habitatge, esperant resposta)
  • CTTI diu "la línia 673006415 té configurada la ip fixe 81.60.233.7"

• cutadapt
• spades
• skesa
• quast
• pgap
  • comprovar container (docker://ncbi/pgap_2023-10-03.build7061)

• esperar sbusquets demani ajuda

Segmentació per aparell consum elèctric edifici H2O. Consulta feta a C2i. Manteniment i rdiaz també participen.

• Reunió amb DSET + Eduard (parc manteniment)
• Carpeta "htdocs/segmentacio-kwh". Provar llibreria knx (npm install knx) (npmjs.com/package/knx)
• reunió dia 3 Abr
• reunió 10ABR isanchez+eduard
• esperar dvila(DSET) i eduard(PARC) executin segons el parlat a la reunió
• sigfox HTTP REST API (https://support.sigfox.com/apidocs)
• esperar resposta manteniment parc

• login investigadors ICRA
  • provar ssh tunel (funciona)
• implementar canvis reunió 10-Abr-24
• Notes Reunió 2024-09-19 * assistents: mpijuan, vrocasalva, ncaceres, cgutierrez, lbosch
  • treure àrees
  • crear usuari "visitants" (login visitants)
  • per poder firmar (posar nom del visitant)
  • filtrar documents per perillositat
  • filtrar projectes per actiu/inactiu
  • [2025-01-20] ncaceres: poder pujar pdfs FDS

• comprar Relé de 220V-AC, 30V-DC, activable amb senyal de 5V
• o bé comprar transistor MOSFET de 24V, activable amb senyal de 5V
• trobada botiga a girona (BTS electrònica, Carrer de Valladolid, 7, 17005 Girona)
• status: asegues diu comprarà peces (2024-04-02)
• recopilar: transformador(220V-24V), cables i endolls per muntatge:
  

• Comentar amb rdiaz
• Comentar amb vacuña (li sembla bé)

• apedregal contacta autors per compilar només app de terminal
• els autors responen que no enviaran el codi
• [2024-04-19] singularity pull docker://mtapiio/wine8 funciona
• [2024-04-19] instalar dins del cluster
• [2024-04-25] apedregal i dmercado fan proves i em diuen algo

• reunió per dissenyar web

• noves (706 a 719)
• (lide mirarà) falta confirmar el "Naphrax" FDS-706.pdf
• noves (720 a 749)

paretverda.icradev.cat

• afegir visualitzador PLC modbus dins d'aquest domini
• ips fixes: 192.168.103.75, 192.168.103.76
• preguntar estat PLC albert i implementar llibreria modbus
• visor implementat a: paretverda.icradev.cat/plc
• programar lectures cada 1h/2h (72min?)
• programar timestep lectures cada 5 min quan s'engegui la bomba

• oliu compra aparell BLE/ANT+
• script de python que alimenti sqlite i jo faig web

• Obj.2. Gestió de dades biofísiques i socioeconòmiques: Recollir, validar, tractar i emmagatzemar dades biofísiques i socioeconòmiques rellevants per a millorar la precisió i actualització dels models de valorització dels serveis recreatius i estètics dels paisatges fluvials.
• Obj. 5: Sistema d’ajuda a la presa de decisions (SAD): Millorar la usabilitat i accessibilitat del SAD per a usuaris no especialitzats. Assegurar que el SAD compleixi amb els requisits específics per a la proposta d'estratègies basades en objectius ambientals i la seva avaluació socioeconòmica

• kaiju (https://github.com/bioinformatics-centre/kaiju)
• centrifuge (https://github.com/DaehwanKimLab/centrifuge/releases)
• instalar firefox i chrome al cluster
• pcolman fa prova i em diu si tot ok

[root][~]# cat /proc/sys/vm/max_map_count
65530
[root][~]# sysctl vm.max_map_count=262144
[root][~]# cat /proc/sys/vm/max_map_count
262144


• spades
• quast.py
• fastQC
• trimmomatic
• ncbi-genome-download
• agnostos
• pcolman fa prova i em diu si tot ok

orbitrap.icradev.cat

• afegir columna (area-blank)
• restar blank a MM (MM_Blank_AIF)
• restar blank a mostres (Blank_HPLC_AIF)
• fer mitjana i desviació estàndard rèpliques (a,b,c)
• afegir desviació estàndard al càlcul de Recovery
• tenir en compte que el recovery pot tenir diferents nivells (100ppb, 50ppb...)
• després de restar el blanc a l'àrea, calcular regressió MM i descartar valors negatius o zero o "N/F"
• discutir més endavant exportació resultats

• descarregar models (7TB) a disc dur icra wolf

covidvigilancia.icra.cat

• iframe variants dins de sarsaigua.icra.cat
• (no urgent) generació automàtica informes
• afegir api variants zenodo
• agrupació de 5 edars (DGIR, DLLE, DTAR, DPDL, DBSS) per gràfic N1 mitjana

indicadors.icradev.cat

• Indicadors de centre (2023-2029) (cada any)
• Indicadors IP (cada 3 anys)
• API calls a:
  • Scopus (ok)
  • MS SQL Server (icranet) (ok)
  • api SAGE
  • afegir api open alex (segons reunió amb etornés)
  • Investigar graph api microsoft per llegir documents power bi

standards.icradev.cat

• TODO list development a la mateixa web (login)

aiguaneix.icradev.cat

• implementar conversor CSV a SQL
• graph api microsoft llegir correu aiguaneix@icra.cat

• solucionat fent servir servei extern

web projecte H2OSEG.es

• instalar wordpress
• accés ssh al loading per "agustin"

web per unificar taules (punts/sequera/cabal/geometria)
h2oseg.icradev.cat

crear web estàtica pròxims esdeveniments a TV entrada

• demanar accés mysql de wordpress
• test accés
• crear icra.cat/esdeveniments_api script php que generi json
• esdeveniments.icradev.cat creat
• comentar amb Sady i Pau

Estudi de gènere en articles científics de diversos camps al llarg dels anys

Integrar en un codi les següents eines:

• scimagojr
• openAlex
• genderize.io
• scopus

instalar snakemake repositori al cluster